Jurjen Hempel a étudié la direction d’orchestre avec David Porcelijn et Kenneth Montgomery au Conservatoire d’Utrecht. À l’invitation de Seiji Ozawa, il a suivi un stage de direction d’orchestre au Tanglewood Music Center, où il a travaillé avec Bernard Haitink et Lorin Maazel. En tant que finaliste et lauréat du Concours de direction d’orchestre Sibelius, il a reçu de nombreuses invitations d’orchestres finlandais.
En 1997, Jurjen Hempel a été nommé chef d’orchestre assistant de Valeri Guerguiev à l’Orchestre philharmonique de Rotterdam. En mai 1997, il a fait des débuts très remarqués avec cet orchestre au Concertgebouw d’Amsterdam. Dans le domaine de l’opéra, Hempel a travaillé avec la compagnie de l’Opéra Mariinski à Saint-Pétersbourg, où il a dirigé Salomé de Richard Strauss. Il est le tout premier chef d’orchestre néerlandais à diriger dans ce célèbre théâtre. Il a ensuite été réinvité à diriger la même production au Nouveau Théâtre d’Israël, à Tel Aviv. Parmi ses autres productions d’opéra, citons La Damnation de Faust de Berlioz avec l’Opéra de Limoges, Don Giovanni avec l’Opera Zuid de Maastricht et, entre autres, l’opéra tant attendu de Brian Ferneyhough, Shadowtime, qui a été présenté à Munich, Londres, Paris, Bochum et New York. Après son succès dans L’Enlèvement au sérail de Mozart, l’Opéra de Toulon l’a nommé directeur musical à partir de 2018.
Il a récemment dirigé l’Orchestre philharmonique des Pays-Bas, l’Orchestre philharmonique d’Helsinki, l’Orchestre symphonique de la Radio finlandaise, l’Orchestre symphonique de Bâle, l’Orchestre symphonique de la BBC (Londres), l’Orchestre symphonique de la BBC d’Écosse (Glasgow), l’Orchestre symphonique de la BBC du Pays de Galles (Cardiff) et le Deutsches Symphonie-Orchester de Berlin. Il a également été invité à deux reprises par l’Orchestre du Concertgebouw d’Amsterdam. Jurjen Hempel a réalisé des enregistrements pour Decca/Argo, Composer’s Voice, Elektra Nonesuch et Point Music.